Одноклеточный атлас рака яичника: HLA-DR-высокие Treg связаны с устойчивостью к платине

Исследователи опубликовали в Journal of Ovarian Research одноклеточный атлас Т- и В-лимфоцитов при серозной карциноме яичника высокой степени злокачественности (HGSOC), самой смертельной гинекологической опухоли. Они собрали парные образцы опухоли и периферической крови у пяти пациенток, ранее не получавших лечения, и получили 35 103 качественные одиночные клетки: 17 667 Т-клеток и 17 436 В-клеток biomedcentral.comJournal of Ovarian Researchbiomedcentral.comОткрыть источник ↗. Клетки выделяли методом FACS и анализировали с помощью одноклеточного РНК-секвенирования и секвенирования TCR/BCR на платформе 10x Genomics, а также проточной цитометрии.

Авторы отмечают, что ограниченный ответ HGSOC на иммунотерапию в основном связывают с плохой инфильтрацией Т-клетками, их функциональным истощением и неполной изученностью иммунного микроокружения.

Treg и истощённые CD8 Т-клетки в опухоли

Иммунный ландшафт был резко разделён по компартментам. CD4 регуляторные Т-клетки (Treg) и истощённые CD8 Т-клетки (Tex) были обогащены в опухолях, тогда как в крови преобладали наивные и памятные лимфоциты. Анализ TCR показал клональную экспансию CD8 Tex и CD4 Treg в микроокружении опухоли; сильнее всего експандировали CD8 Tex, следуя траектории дифференцировки от предшественников Teff/Tm.

Команда выявила обогащённую в опухоли субпопуляцию HLA-DR-высоких Treg с повышенной экспрессией MHC класса II, окислительным фосфорилированием и усиленной экспрессией TNFR2. Эта субпопуляция была связана с устойчивостью к платине и худшей выживаемостью biomedcentral.comJournal of Ovarian Researchbiomedcentral.comОткрыть источник ↗. Анализ межклеточной коммуникации в CellChat показал плотное взаимодействие этих Treg с CD8 Tex через TNFR2 и MIF/IL16, которое подтвердили иммуногистохимия (ИГХ) и мультиплексная ИГХ в платинорезистентных опухолях. Для проверки использовали также проточную цитометрию в независимой когорте из 33 пациенток.

Плазмобласты и созревание В-клеток

Опухоли были инфильтрированы плазмобластами и В-клетками памяти. Анализ репертуара показал активные соматические гипермутации и переключение классов иммуноглобулинов на IgG и IgA, что авторы трактуют как антиген-зависимую активацию.

При деконволюции CIBERSORT в когортах TCGA и ICGC высокая плазмобластная сигнатура была независимым благоприятным прогностическим фактором и ассоциировалась с иммунологически активным микроокружением опухоли. Мультиплексная ИГХ показала меньше плазмобластов в платинорезистентных опухолях.

Авторы заключают, что ось HLA-DR-высоких Treg и TNFR2 способствует истощению CD8 Т-клеток и устойчивости к платине, а плазмобластная сигнатура связана с благоприятным прогнозом. По их утверждению, результаты важны для стратификации пациенток и разработки комбинированной иммунотерапии HGSOC biomedcentral.comJournal of Ovarian Researchbiomedcentral.comОткрыть источник ↗. Когорта открытия состояла из пяти пациенток.