Снижение активности TOP1 усиливает амплификацию транскрипции белком MYC в клетках и биохимических тестах
Авторы создали систему, разделяющую активацию и амплификацию транскрипции под действием MYC, и связали амплификацию со сверхспирализацией ДНК. Данные получены в клетках и биохимических тестах.
Исследователи сообщили в журнале Proceedings of the National Academy of Sciences о системе, которая различает активацию транскрипции под действием MYC и её амплификацию в любой клетке pnas.org
Proceedings of the National Academy of Sciencespnas.orgОткрыть источник ↗. Нарушенная регуляция MYC резко меняет экспрессию генов при раке. Обычно MYC считают E-box-зависимым активатором транскрипции, тогда как альтернативная модель рассматривает его как универсальный усилитель транскрипции.
Система позволяет авторам изучать гены, кофакторы и соединения, которые реализуют или изменяют активность MYC. С помощью биохимических и клеточных тестов они описывают динамическое взаимодействие между амплификацией транскрипции под действием MYC и сверхспирализацией ДНК. Известно, что MYC стимулирует топоизомеразы, устраняющие топологические проблемы ДНК, которые осложняют его работу. Как эта стимуляция согласована с его ролью в транскрипции, прежде не изучали.
Снижение активности TOP1, генетическим нокдауном или низкой дозой ингибитора, усиливает амплификацию транскрипции под действием MYC. Ранние стадии транскрипции чувствительны к сверхспирализации ДНК. По данным авторов, отрицательная сверхспирализация усиливает плавление промотора и загрузку РНК-полимеразы. Так создаются ранние транскрипционные комплексы, на которые действует MYC, повышая выход транскрипции.
