Токийский университет: у глубоководных «морских свиней» найден симбионт с геномом 649000 оснований
Исследователи описали бактерию Candidatus Abyssoplasma scotoplanesicola: на неё пришлось более 70% бактериальных последовательностей 16S в стенке тела, а в геноме есть гигантские белки.
Исследователи Токийского университета описали бактерию, которая живёт под покровом глубоководных «морских свиней» — одного из видов голотурий (морских огурцов). Об этом говорится в релизе, опубликованном на EurekAlert 11 ноября 2026 года eurekalert.org
EurekAlerteurekalert.orgОткрыть источник ↗. Авторы назвали её Candidatus Abyssoplasma scotoplanesicola. Геном бактерии составляет всего 649000 оснований, и больше четверти его кодирует белки, связанные с поверхностью клетки.
Образцы и локализация
Группа из нескольких японских учреждений выделила ДНК из разных тканей восьми «морских свиней», собранных в глубоководных экспедициях. Исследователи определили, какие бактерии преобладают в разных частях тела, восстановили геномы доминирующих форм и с помощью флуоресцентной визуализации нашли, где эти бактерии расположены в тканях хозяина.
В образцах стенки тела трёх видов «морских свиней» одна бактерия давала более 70% последовательностей гена 16S рРНК — генетического маркера для определения бактерий, сообщил ведущий автор Ю Ёсида. Бактерия относится к линии симбионтов морских беспозвоночных, но заметно отличается от известных форм. Поэтому авторы предлагают выделить для неё новый род и вид.
Сокращённый геном и гигантские белки
Геном E. coli примерно в семь раз больше, чем у новой бактерии, отметил Ёсида. Гены некоторых путей получения энергии, обычных для бактерий, обнаружены не были eurekalert.org
EurekAlerteurekalert.orgОткрыть источник ↗. Гены групп поверхностных белков занимают 27,6% генома. Среди них есть белки длиннее 5000 аминокислот, тогда как бактериальные белки в среднем содержат около 300. По предположению авторов, такие белки могут участвовать во взаимодействии с тканями хозяина или в объединении бактерий в скопления.
Судя по геному, бактерия, вероятно, получает от тканей хозяина аминокислоты, предшественники нуклеиновых кислот, липиды и минеральные вещества. Что получают от этих отношений сами «морские свиньи», пока неизвестно. Роль в защите хозяина от патогенов возможна, но не подтверждена.
Авторы намерены выяснить, как бактерия стала настолько доминирующей в стенке тела, какие функции выполняют гигантские поверхностные белки, с какой конкуренцией со стороны других бактерий она сталкивается и как влияет на хозяина. Работа представляет собой наблюдательное исследование и опубликована в ISME Host Microbe (DOI 10.1093/ismehm/aazag018).
