Перуанские учёные нашли у какао из сухого леса Луя родство с Криолло, проанализировав 151 образец
Генотипирование 151 образца какао из Амасонаса и Куско по 15 SSR-маркерам сблизило деревья из Луя с мезоамериканским Криолло; сухой лес Мараньон ранее генетически не изучали.
Исследователи из Национального университета Торибио Родригес де Мендоса в Амасонасе и Национального межкультурного университета Кильябамбы провели генотипирование 151 образца какао (Theobroma cacao L.) из семи популяций в регионах Амасонас и Куско в Перу. Результаты опубликованы в журнале Genetic Resources and Crop Evolution springer.com
Genetic Resources and Crop Evolutionspringer.comОткрыть источник ↗. По данным пересказа издания, 136 образцов собрали в Амасонасе и 15 в Куско. Авторы использовали 15 микросателлитных SSR-маркеров, шесть из которых разработали сами по открытым геномным данным.
Разнообразие образцов Амасонаса и Куско
Маркеры выявили 175 аллелей, от 2 до 25 на локус. Наибольший полиморфизм показал новый ядерный маркер INDES_mTC98. У каждого образца был уникальный мультилокусный генотип, то есть клонов в выборке не оказалось.
Анализ структуры популяций дал четыре генетических кластера из 2, 13, 25 и 111 особей. Они объяснили 64,90% общей внутривидовой изменчивости, а генетическую основу авторы связывают с пятью предковыми популяциями. Популяция Куско, состоявшая в основном из образцов какао Чунчо, заметно отличалась от популяций Амасонаса.
Деревья Луя и группа Криолло
Популяцию Луя составили образцы из защищаемой территории сезонно сухих тропических лесов Мараньон или из её окрестностей. Картина равновесия по сцеплению согласуется с прошлой случайной половой рекомбинацией, без клонального размножения, которое обычно осуществляет человек springer.com
Genetic Resources and Crop Evolutionspringer.comОткрыть источник ↗.
Образцы Луя затем генотипировали по 96 однонуклеотидным маркерам (SNP). Они сгруппировались рядом с мезоамериканским Криолло и группой Piura Porcelana. По данным пересказа издания, проверили 12 образцов Луя, три исключили из-за ошибок. Из оставшихся деревьев четыре попали в кластер Криолло и пять в кластер Piura Porcelana. Родство с Криолло восходит к одной предковой популяции.
Авторы указывают, что выявленные связи говорят об исторических контактах северных перуанских популяций какао с материалом, родственным Криолло. Для выяснения эволюционной истории, по их словам, нужны дальнейшие исследования. Труднодоступный сухой лес вдоль реки Мараньон они называют малоизученным резервуаром генетического разнообразия какао, важным для сохранения и селекции.
