Алармон ppGpp напрямую ингибирует фермент модификации тРНК MnmE у Bacillus subtilis и влияет на биоплёнку

Исследователи сообщили в Science Advances, что алармон гуанозинтетрафосфат (ppGpp) напрямую ингибирует MnmE (TrmE) — консервативную ГТФазу, модифицирующую тРНК. Фермент необходим для метиламинометильной (mnm) модификации колебательного уридина doi.orgScience Advancesdoi.orgОткрыть источник ↗. Работа связывает стрессовую сигнализацию бактерий с кодон-специфичным контролем трансляции doi.orgScience Advancesdoi.orgОткрыть источник ↗.

С помощью рибосомного профилирования высокого разрешения у Bacillus subtilis авторы обнаружили, что потеря MnmE избирательно усиливает паузы рибосом на кодонах AAG. Она также перепрограммирует трансляцию части генов, включая малые открытые рамки считывания doi.orgScience Advancesdoi.orgОткрыть источник ↗.

Среди них — ранее неизвестный лидерный пептид с кодонами AAG, который контролирует экспрессию репрессора биоплёнки AbrB doi.orgScience Advancesdoi.orgОткрыть источник ↗. В согласии с этим мутанты mnmE постоянно производят внеклеточный матрикс и обходят дефект биоплёнки мутанта relA doi.orgScience Advancesdoi.orgОткрыть источник ↗. Авторы описывают путь, связывающий сигнализацию ppGpp, модификацию тРНК, кодон-специфичную трансляцию и многоклеточное развитие doi.orgScience Advancesdoi.orgОткрыть источник ↗.