Генетика кукурузы в центре её происхождения слабо связана с языками людей: анализ около 2000 сортов

В журнале Proceedings of the National Academy of Sciences опубликована работа о том, как деятельность человека формирует генетическое разнообразие кукурузы в Америке. Авторы использовали открытые данные генотипирования и паспортные данные примерно 2000 традиционных сортов кукурузы, более 500 полных геномов жителей Мексики и карты языков коренных народов doi.orgProceedings of the National Academy of Sciencesdoi.orgОткрыть источник ↗. Кукуруза — основная культура, имеющая огромное культурное значение для коренных народов Америки, и не может выживать и распространяться без земледельцев.

Работа количественно оценивает антропогенные эффекты, которые в исследованиях популяционной структуры и влияния среды часто остаются неизмеренными doi.orgProceedings of the National Academy of Sciencesdoi.orgОткрыть источник ↗.

Слабая общая структура

У кукурузы очень мало выраженной общей генетической структуры. Авторы связывают это с эффективностью, с которой коренные земледельцы перемещали и смешивали популяции кукурузы doi.orgProceedings of the National Academy of Sciencesdoi.orgОткрыть источник ↗. Главные компоненты разнообразия кукурузы коррелируют с генетическим разнообразием людей. Однако линейное моделирование указывает на малый дополнительный вклад структуры человеческих популяций сверх общей географии doi.orgProceedings of the National Academy of Sciencesdoi.orgОткрыть источник ↗.

Язык и отдельные локусы

На локальном уровне различия в разнообразии кукурузы часто соответствуют языкам, но на больших пространственных масштабах эффекты по всему геному слабые doi.orgProceedings of the National Academy of Sciencesdoi.orgОткрыть источник ↗. Несмотря на слабый глобальный сигнал, лингвистический GWAS, анализ выбросов по FST и сканирование отбора выявили локусы, связанные с отдельными языками doi.orgProceedings of the National Academy of Sciencesdoi.orgОткрыть источник ↗.

Используя данные секвенирования на уровне ландшафта, авторы описывают, как антропогенные факторы сформировали картину генетического разнообразия кукурузы в Мезоамерике doi.orgProceedings of the National Academy of Sciencesdoi.orgОткрыть источник ↗.