Геном двупалого ленивца: Wellcome Sanger Institute нашёл рекордные 15 898 копий генов, 38 — кандидаты
В геноме двупалого ленивца больше копий генов, чем описано у любого млекопитающего. Авторы связывают 38 из них с энергетическим обменом, но это пока гипотеза.
Группа под руководством Марселы Улиано-Силва из Wellcome Sanger Institute в Кембридже и Камилы Маццони из Института исследований зоопарков и дикой природы Лейбница в Берлине секвенировала геном двупалого ленивца, сообщает Earth.com. Животное, Lama Su, жило в Tierpark Berlin. Готовый геном содержит около 3,2 миллиарда букв, почти каждая из которых размещена на хромосоме. Работа опубликована в BMC Biology. earth.com
Earth.comearth.comОткрыть источник ↗
Ленивцы могут обходиться менее чем половиной энергии, ожидаемой для млекопитающих их размера, и причина этого не объяснена.
Рекордное число копий генов
Механизм «прыгающих генов» может также скопировать сообщение, считанное с обычного гена, и записать его обратно в ДНК как новую копию, без переключателей, включающих ген. В геноме двупалого ленивца таких копий 15 898. У человека их около 8000, у других млекопитающих обычно от 2000 до 8000. Ни у одного другого животного не описано больше.
У четырёх других ксенартр в сравнении было более 10 000 копий, а у двупалого ленивца некоторые отдельные гены скопированы более 100 раз. Около 32% копий ленивца есть и как минимум у одного из двух других ленивцев, и ни у одного другого проверенного животного, что относит их появление примерно к 30 миллионам лет назад. Среди копий, найденных только у двупалого ленивца, почти 16% настолько близки к родительскому гену, что созданы недавно или создаются до сих пор. earth.com
Earth.comearth.comОткрыть источник ↗
От 5123 копий до 38 кандидатов
Команда начала с 5123 копий, общих только с другими ленивцами. Из них 2347 были активны хотя бы в одной из пяти тканей, 525 сохранили не менее 70% инструкции родительского белка, а 123 показали признаки защиты естественным отбором. После ручной проверки прочтений осталось 38.
Многие из 38 — копии генов, работающих в митохондриях. Другие происходят от генов, связанных с жирами или с реакцией клетки на стресс.
Авторы предполагают, что копии могут служить генетическими «резервными системами» для митохондрий, на которые действует ослабленное давление, но называют это гипотезой. earth.com
Earth.comearth.comОткрыть источник ↗ Что делает любая из копий в живой клетке, не проверялось, а результат по митохондриальной ДНК, на котором держится идея, не опубликован. Кроме того, в сравнении был один муравьед и один броненосец из 11 и 25 ныне живущих видов. Команда планирует вырастить клетки ленивца в лаборатории и проверить копии на них.
