MELISA Institute: dia-PASEF количественно определил 4229 белков в цервиковагинальной жидкости против 2817

Группа из MELISA Institute (Сан-Педро-де-ла-Пас, Консепсьон, Чили) сравнила два масс-спектрометрических метода для продольного анализа цервиковагинальной жидкости (CVF). Работа опубликована в Scientific Reports 13 октября 2026 года и доступна на nature.com. Образцы взяты из когорты прегравидарного наблюдения EARLY-PREG. С помощью метода независимого от данных сбора спектров dia-PASEF авторы количественно определили 4229 белков, с dda-FracOffline — 2817 nature.comnature.comnature.comОткрыть источник ↗.

Дизайн исследования и образцы

EARLY-PREG — открытая когорта, в которую женщины включаются до беременности, а каждый образец фиксируется относительно менструального цикла. По данным пресс-релиза, за точку отсчёта овуляции команда принимает пик лютеинизирующего гормона в моче nature.comnature.comnature.comОткрыть источник ↗. Серийные образцы CVF собирали в семидневном окне, привязанном к овуляции (d0–d6).

По сообщению института, оба метода применили к одним и тем же 42 образцам: шесть участниц сдавали по одному образцу в день в течение семи суток цикла без зачатия. Опорой для попарных сравнений по дням служил день 0 — день овуляции nature.comnature.comnature.comОткрыть источник ↗.

Охват и воспроизводимость

Средний коэффициент вариации составил 5,27 ± 0,68 % для dia-PASEF и 9,37 ± 1,75 % для dda-FracOffline, то есть измерения первым методом оказались более согласованными nature.comnature.comnature.comОткрыть источник ↗. В релизе прирост числа количественно определённых белков оценён примерно в 50 %.

В попарных сравнениях с днём 0 dia-PASEF выявил 952–1116 дифференциально экспрессирующихся белков против 161–460 у dda-FracOffline nature.comnature.comnature.comОткрыть источник ↗. Анализ путей показал более широкий биологический охват у dia-PASEF.

Авторы заключают, что dia-PASEF — чувствительный и воспроизводимый подход для анализа CVF в схеме повторных измерений, и сообщают, что его можно адаптировать к другим биожидкостям nature.comnature.comnature.comОткрыть источник ↗. Они отмечают, что масштабному поиску биомаркёров в CVF мешали ограничения чувствительности, воспроизводимости и полноты данных масс-спектрометрических методов. Институт заявляет, что метод создаёт основу для исследований фертильности, самых ранних стадий беременности и возможных биомаркёров гинекологических заболеваний. Это методическая работа; клинических биомаркёров в ней не приводится.