Геном шерстистого носорога возрастом 14 400 лет из желудка волчонка не показал признаков упадка

Группа исследователей секвенировала геном высокого покрытия шерстистого носорога (Coelodonta antiquitatis), жившего около 14 400 лет назад. Работа опубликована 14 января в журнале Genome Biology and Evolution oup.comGenome Biology and Evolutionoup.comОткрыть источник ↗. Источником стала мышечная ткань из желудка волчонка, сохранившегося в вечной мерзлоте на севере Сибири. Вид вымер около 14 000 лет назад.

Носорог из желудка волка

Волчонку было около двух месяцев. Исследователи нашли его вблизи посёлка Тумат в 2011 году, а второго волчонка в 2015 году; у обоих сохранились кожа, шерсть и зубы. В желудке были остатки трясогузки, шерстистого носорога и арктической травы. Фрагмент носорога был покрыт желтоватой шерстью.

Чтобы избежать загрязнения ДНК волка, команда в течение нескольких месяцев брала пробы из разных участков фрагмента. Высохшую твёрдую ткань резали скальпелем, секвенировали ДНК наилучшего качества и объединяли результаты в полный геном. Анализ показал, что это была самка.

Разнообразие, инбридинг и вымирание

Авторы сравнили этот геном с двумя другими геномами позднеплейстоценовых сибирских шерстистых носорогов, принадлежавших животным возрастом около 18 000 и 49 000 лет. Сравнивали геномное разнообразие, инбридинг, генетический груз и изменения численности популяции oup.comGenome Biology and Evolutionoup.comОткрыть источник ↗. Признаков сокращения популяции и эрозии генома незадолго до гибели вида не обнаружено.

В геноме возрастом 14 400 лет мало длинных гомозиготных участков, которые обычно указывают на недавний инбридинг. Отсюда авторы делают вывод, что за несколько столетий до вымирания численность популяции была стабильной. По их выводу, вымирание, вероятно, произошло быстро, в течение потепления Бёллинг-Аллерёд.

Авторы считают, что результат дополнительно поддерживает версию о внезапной внешней причине, например изменении климата. Среди объяснений вымирания предлагались также изменение климата, инбридинг и охота человека. Статья не решает, какое из них верно.

Исследование показывает также, что ДНК высокого качества можно получить из неожиданных источников, таких как содержимое желудка хищника, и по ней реконструировать, как исчезал вид oup.comGenome Biology and Evolutionoup.comОткрыть источник ↗.