Уровень внеклеточной ДНК связан с метилированием рака: исследование 1480 участников из 43 клиник

В исследовании, опубликованном в Proceedings of the National Academy of Sciences, проанализированы данные 1480 участников без предшествующего лечения из 43 больниц. В когорту вошли пациенты с 14 типами рака всех стадий, пациенты с доброкачественными образованиями и здоровые добровольцы doi.orgProceedings of the National Academy of Sciencesdoi.orgОткрыть источник ↗.

У онкологических больных в крови больше циркулирующей внеклеточной ДНК (ccfDNA) — мелких фрагментов ДНК, попадающих в кровь, — чем у здоровых людей. Основная часть избытка происходит из иммунных клеток, а не из опухоли, поэтому предполагалось, что она лишь разбавляет гораздо меньшее количество ДНК опухолевого происхождения doi.orgProceedings of the National Academy of Sciencesdoi.orgОткрыть источник ↗.

Метилирование растёт вместе с ccfDNA

Авторы получили обратный результат: с ростом общей ccfDNA в ней увеличивалась доля фрагментов с метилированием, характерным для рака. Это не зависело от типа рака, стадии и широкого набора демографических, клинических и технических ковариат doi.orgProceedings of the National Academy of Sciencesdoi.orgОткрыть источник ↗. Общая ccfDNA объясняла больше дисперсии метилированного сигнала, чем стадия заболевания doi.orgProceedings of the National Academy of Sciencesdoi.orgОткрыть источник ↗. Авторы предполагают связь между активностью иммунных клеток и метилированием опухоли.

Чувствительность по концентрации

Чувствительность обнаружения рака росла с концентрацией ccfDNA, в том числе внутри отдельных стадий. На стадии I она составила от 0,55 в нижнем терциле концентрации до 0,85 в верхнем, на стадии II — от 0,59 до 0,86 doi.orgProceedings of the National Academy of Sciencesdoi.orgОткрыть источник ↗. Авторы предлагают учитывать концентрацию ccfDNA как не зависящую от стадии переменную стратификации при сравнении тестов на рак.

Похожая картина наблюдалась у пациентов с симптомными доброкачественными образованиями. Авторы трактуют это как более широкую реакцию на аномальный рост тканей, а не особенность одних лишь злокачественных опухолей doi.orgProceedings of the National Academy of Sciencesdoi.orgОткрыть источник ↗.