Метод MAP-IT картирует белковые взаимодействия прямо в срезах первичной ткани человека

Группа из отдела фармакологии Weill Cornell Medical College (Нью-Йорк) и Медицинского колледжа Университета Йонсе (Сеул) описала метод MAP-IT для картирования белок-белковых взаимодействий (PPI) непосредственно в срезах первичной ткани человека. Статья Сары К. Фолкнер (Sarah C. Faulkner), Чарльза Д. Уоррена (Charles D. Warren), Ноа Ярдени (Noah Yardeny) и коллег опубликована в Nature Communications 3 ноября 2026 года; автор для переписки — Джейкоб Б. Джери (Jacob B. Geri). doi.orgNature Communicationsdoi.orgОткрыть источник ↗ MAP-IT — оптимизированный фотокаталитический метод проксимального мечения на основе карбенов. doi.orgNature Communicationsdoi.orgОткрыть источник ↗

Авторы отмечают, что PPI в изменённых болезнью тканях составляют перспективный класс потенциальных мишеней для лекарств. Однако такие взаимодействия обычно выявляют в живых клетках, в лизате и в генетически модифицированных модельных организмах, что, по словам авторов, ограничивает переносимость результатов на болезни человека. doi.orgNature Communicationsdoi.orgОткрыть источник ↗

Картирование взаимодействий в срезах ткани

По данным авторов, MAP-IT позволяет обойтись без модельных организмов на первом этапе поиска, поскольку мечение проводят на срезах первичной ткани человека. doi.orgNature Communicationsdoi.orgОткрыть источник ↗ С помощью метода команда составила профили PPI in situ для белков-мишеней, расположенных на поверхности клетки и в ядре. doi.orgNature Communicationsdoi.orgОткрыть источник ↗

На материале колоректального рака авторы выявили новых партнёров EGFR и подтвердили их ортогонально, то есть независимым методом. doi.orgNature Communicationsdoi.orgОткрыть источник ↗ В статье это представлено как демонстрация подхода на ткани человека; данные касаются партнёров по взаимодействию белка, а не какого-либо лечения. doi.orgNature Communicationsdoi.orgОткрыть источник ↗

Мечение с пространственным рисунком освещения

Реакция мечения в MAP-IT запускается светом. Авторы совместили её с пространственно заданным облучением видимым светом, которое направляется сегментацией изображения, чтобы картировать интерактомы белков в зависимости от расположения. doi.orgNature Communicationsdoi.orgОткрыть источник ↗ Так набор партнёров по взаимодействию можно привязать к определённой области среза, а не усреднять по всему образцу. doi.orgNature Communicationsdoi.orgОткрыть источник ↗

В работе участвовали несколько подразделений: отдел фармакологии Weill Cornell Medical College, Tri-Institutional PhD Program in Chemical Biology в Нью-Йорке, а также отделения внутренней медицины, хирургии (колоректальная хирургия) и патологии вместе с Yonsei Cancer Center при Медицинском колледже Университета Йонсе в Сеуле. doi.orgNature Communicationsdoi.orgОткрыть источник ↗