Исследование 894 собак: у крупных пород быстрее теряется метилирование LINE1
В Science описаны 1640 метиломов 894 собак: у крупных пород и самцов эпигенетическое старение ускорено, а эффект размера связан с транспозонами.
Группа под руководством Ноа Снайдер-Маклера из Университета штата Аризона проанализировала 1640 метиломов 894 собак, участвующих в проекте Dog Aging Project, говорится в исследовании, опубликованном в Science. science.org
Sciencescience.orgОткрыть источник ↗ Авторы построили эпигенетические часы по метилированию ДНК и проверили, как собственная скорость биологического старения связана с продолжительностью жизни, которая у разных пород собак сильно различается.
Эпигенетические часы и смертность
Часы предсказывали смертность. У собак, чей эпигенетический возраст превышал ожидаемый, был повышен риск смерти, сообщили авторы. Эпигенетическое старение шло быстрее всего в начале жизни.
В ортологах генов человека, связанных с возрастом, у собак обнаружены согласованные возрастные изменения метилирования промоторов; авторы трактуют это как сохранённую перестройку иммунных путей. У более крупных собак и самцов, которые живут меньше, молекулярное старение было ускорено. Эти эффекты имели разную эпигенетическую природу: связанные с полом изменения метилирования были сосредоточены на X-хромосоме.
Транспозоны и размер тела
Метилирование, связанное с размером, особенно выражено в транспозонах (мобильных элементах ДНК). science.org
Sciencescience.orgОткрыть источник ↗ С возрастом метилирование в целом снижалось, заметнее всего в этих последовательностях. Более 40 процентов участков генома, связанных с LINE1, теряли метилирование с возрастом, причём скорость у разных собак различалась.
У крупных пород потеря шла быстрее: они теряли примерно на 35 процентов больше метилирования LINE1 в год, чем мелкие. Элементы LINE1 способны повреждать ДНК при перемещении по геному, а метилирование обычно сдерживает эту активность.
Соведущий автор Блейз Маринер заявил, что результат указывает: более быстрое старение крупных собак может отчасти объясняться ослабленным контролем над этими элементами. Авторы называют транспозоны возможными посредниками связи размера с продолжительностью жизни и отмечают, что половые эффекты на X-хромосоме требуют дальнейшего изучения.
Снайдер-Маклер также заявил, что транспозоны могут быть базовой частью процесса старения у млекопитающих. Это остаётся гипотезой авторов: работа сравнивает паттерны метилирования у собак, а выводы о других видах и о методах для человека в ней не проверялись.
