Митогеномы скота породы Рендена: 86 материнских гаплотипов у 137 животных, уточнено дерево T3

Исследователи секвенировали полные митохондриальные геномы 137 голов скота породы Рендена и 31 головы альпийской серой породы, сообщается в работе в журнале Genetics Selection Evolution. Рендена — порода комбинированного направления из Валь-Рендена, изолированной альпийской долины на севере Италии. Животных Рендена отобрали так, чтобы представить большинство материнских линий породы. biomedcentral.comGenetics Selection Evolutionbiomedcentral.comОткрыть источник ↗

Местные заводчики сохранили породу, несмотря на тяжёлые эпидемии. Прежние полногеномные исследования выявили у скота Рендена признаки отбора, но об эволюционной истории породы было известно мало; на этот вопрос и был направлен анализ митогеномов.

Разнообразие гаплотипов и гаплогруппы

Авторы выявили у скота Рендена 86 различных гаплотипов митохондриальной ДНК при гаплотипическом разнообразии 0,986. Из них 62 встретились у одного животного, а 24 были общими для двух и более. У 31 митогенома альпийской серой породы нашли 27 гаплотипов с разнообразием 0,989.

Практически все образцы относятся к макрогаплогруппе T: на T3 приходится 91%, на T2 — 7%, на T5 — 1%. biomedcentral.comGenetics Selection Evolutionbiomedcentral.comОткрыть источник ↗ Лишь один образец попал в линию Q1. У альпийской серой породы распределение схожее, что указывает на выраженную генетическую близость двух популяций. Авторы допускают либо недавнее общее происхождение, либо исторический обмен генами по материнской линии.

Балканская связь и структура T3

По мнению авторов, наличие редких гаплогрупп T5 и Q1 при высоком общем разнообразии мтДНК говорит о сложной истории породы Рендена. Анализ вариаций Рендена в западноевразийском контексте выявил родственную связь с Балканами. Общих гаплотипов при этом не обнаружено, что подтверждает уникальность материнского генофонда Рендена.

Высокая доля митогеномов T3 позволила пересмотреть и уточнить глобальную филогению этой гаплогруппы. Уточнённое дерево показывает структурирование популяции внутри породы Рендена. Авторы заключают, что T3, доминирующая в Европе гаплогруппа, структурирована гораздо сильнее, чем считалось, что отражает расселение после одомашнивания и региональную дифференциацию.

По оценке авторов, и Рендена, и альпийская серая порода несут высокое материнское разнообразие и сохраняют редкие древние линии таурина. Они отмечают ценность местных исчезающих пород как хранилищ уникальной генетической изменчивости. biomedcentral.comGenetics Selection Evolutionbiomedcentral.comОткрыть источник ↗