Анализ 190 000 пар родитель–ребёнок выявил 58 геномных регионов, связанных с рекомбинацией у человека
Метаанализ когорт из четырёх стран связал 58 регионов генома с частотой и положением рекомбинации; семь из них новые, многие действуют по-разному у женщин и мужчин.
Группа с корреспондентным автором Мэттью Робинсоном из Института науки и технологий Австрии проанализировала 112 144 материнских и 78 653 отцовских мейотических события из четырёх стран. Цель — найти генетические факторы, определяющие, как часто и в каких местах рекомбинируют хромосомы человека, говорится в статье в Nature Communications nature.com
Nature Communicationsnature.comОткрыть источник ↗. По описанию авторов, это крупнейший на сегодня метаанализ мейотической рекомбинации человека.
Мейотическая рекомбинация обеспечивает генетическое разнообразие и расхождение хромосом, но генетические факторы различий в её уровне между исследованиями оставались плохо изученными. Данные взяты из нескольких когорт, в том числе Norwegian Mother, Father and Child Cohort Study, Generation Scotland и Estonian Biobank; в работе участвовала компания deCODE Genetics.
Регионы и различия между полами
Анализ выявил 58 независимых геномных регионов (24 уникальных среди фенотипов), связанных с частотой и положением рекомбинации. Среди них шесть новых регионов, специфичных для женщин, с генами, связанными с функцией яичников, и седьмой новый регион, связанный с рекомбинацией у мужчин. Многие локусы действуют по-разному в зависимости от пола.
Генетическая корреляция между полами составляет 0,374 (0,072 SD), сообщили авторы nature.com
Nature Communicationsnature.comОткрыть источник ↗. ДНК-маркеры объясняют 30–40% индивидуальной вариации частоты рекомбинации. Ранее известные глобальные модуляторы объясняют лишь 37,7% (2,7% SD) этой вариации у женщин и 47,1% (3,8% SD) у мужчин.
Полигенный предиктор и связь с репродукцией
Исследователи построили полигенный предиктор, который значимо предсказывает уровень рекомбинации и у женщин, и у мужчин после поправки на возраст и год рождения. Это означает, что найденные варианты несут пригодную для оценки информацию об индивидуальном уровне рекомбинации в каждом из полов.
Рекомбинация у женщин также значимо коррелирует с репродуктивными исходами и старением после поправки на способ отбора участников исследования. Авторы заключают, что результаты выявляют новые специфичные для пола локусы и проясняют полигенную архитектуру вариации мейотической рекомбинации.
Работа представляет собой статистический генетический анализ имеющихся когортных данных. Она описывает ассоциации между регионами генома и рекомбинацией, а результаты в статье приводятся на уровне популяций и когорт.
