Gemelli IRCCS: профилирование опухолей 2674 пациентов выявило наследственные варианты примерно у 10%

Исследователи Fondazione Policlinico Universitario A. Gemelli IRCCS сообщили, что комплексное профилирование генома солидных опухолей выявило конституциональные патогенные или вероятно патогенные варианты примерно у 10% неотобранной когорты, говорится в статье в Genome Medicine doi.orgGenome Medicinedoi.orgОткрыть источник ↗. Анализ охватывает первые два года программы FPG500, с января 2022 по декабрь 2023 года. В него вошли 2688 образцов от 2674 пациентов, более чем у половины из которых были опухоли женской репродуктивной системы doi.orgGenome Medicinedoi.orgОткрыть источник ↗.

Исследование проспективное, интервенционное. На профилирование направляли пациентов с солидными опухолями, у которых молекулярное тестирование было клинически показано по национальным рекомендациям. Панель анализирует свыше 500 генов. По словам исследователей, в Италии это не входит в стандартную клиническую практику: оплачиваемые тесты охватывают ограниченное число генов, связанных с определёнными видами рака.

Герминальное тестирование и подтверждение

Из-за подозрения на конституциональные варианты на генетическую оценку направили 16% пациентов, речь шла о 527 предполагаемых вариантах; на генетическую консультацию пришли 80% приглашённых doi.orgGenome Medicinedoi.orgОткрыть источник ↗. Герминальное тестирование прошли 331 пациент. Из них у 73% нашли хотя бы один патогенный вариант, а 66% протестированных вариантов подтвердились как герминальные doi.orgGenome Medicinedoi.orgОткрыть источник ↗.

Дополнительные конституциональные варианты выявили у 0,6% всей когорты: по результатам других соматических тестов или тестов, назначенных после генетической консультации doi.orgGenome Medicinedoi.orgОткрыть источник ↗.

Варианты вне действующих рекомендаций

Среди герминальных вариантов 16% были вторичными находками, а 20% подтверждённых вариантов, обнаруженных в опухоли, находились в генах умеренного риска doi.orgGenome Medicinedoi.orgОткрыть источник ↗. Авторы указывают, что такие варианты не были бы выявлены по действующим рекомендациям. По оценке группы, стандартные диагностические маршруты, вероятно, пропустили бы около трети людей с синдромом наследственной предрасположенности к раку.

Команда под руководством Маурицио Дженуарди сообщает, что эти сведения могут помогать в выборе терапии, наблюдении за другими органами риска и мерах снижения риска, таких как профилактическая операция или таргетная медикаментозная терапия. Они также позволяют обследовать родственников и выяснить, унаследовали ли они семейный вариант. Исследование зарегистрировано на ClinicalTrials.gov под номером NCT06020625 doi.orgGenome Medicinedoi.orgОткрыть источник ↗.

Исследователи планируют изучить дополнительные наследственные изменения в генах, не вошедших в проведённый анализ. Они также намерены измерить, сколько пациентов и родственников затем вошли в программы наблюдения и профилактики.