Карта дегронов всех 1626 факторов транскрипции человека: найдены тысячи мотивов
Авторы картировали мотивы деградации во всех факторах транскрипции человека и связали скрытый дегрон с частыми мутациями меланомы в цинковых пальцах.
Исследователи систематически картировали дегроны во всех 1626 факторах транскрипции человека, говорится в работе в Science Advances science.org
Science Advancesscience.orgОткрыть источник ↗. Дегроны — короткие мотивы последовательности, которые распознают E3-убиквитинлигазы, направляя белки на деградацию через убиквитин-протеасомную систему. Скрининг выявил тысячи дегронов, как известных, так и ранее не описанных, а авторы охарактеризовали их последовательности.
Дегроны в открытых и неупорядоченных участках белка регулируют клеточное содержание факторов транскрипции. Самые частые соматические мутации, связанные с кожной меланомой, приводят к разворачиванию цинковых пальцев и открытию скрытого дегрона. Авторы также описывают дегроны, специфичные для клеточных компартментов, и сообщают, что эффекты вариантов в факторах транскрипции коррелируют с силой дегрона.
Более 60% всех предсказанных доменов активации транскрипции перекрываются с сильными дегронами. В остальных трансактивирующих участках кислые остатки ослабляют действие дегрона, сообщают авторы.
