В Институте Вейцмана создан метод LAffAb для оптимизации антител
Структурный алгоритм оптимизировал антитела в пробирке, увеличив сродство к мишени до 30 раз с сохранением стабильности молекулы.
Исследователи из Института естественных наук имени Вейцмана, компании AstraZeneca и партнерских институтов разработали вычислительный метод LAffAb для инженерии антител. Как сообщает журнал Nature Communications, подход использует данные рентгеноструктурного анализа комплекса антиген-антитело для расчета мутаций, оптимизирующих общую энергию взаимодействия doi.org
Nature Communicationsdoi.orgОткрыть источник ↗. Метод позволяет преодолеть компромисс между специфичностью, сродством и физической стабильностью белков.
Комбинаторный скрининг вариантов
Авторы проверили эффективность методики на комбинаторной библиотеке из 7000 вариантов антител, содержащих до девяти точечных замен одновременно. В лабораторных тестах модификации обеспечили прирост аффинности до 30 раз при параллельном улучшении показателей стабильности doi.org
Nature Communicationsdoi.orgОткрыть источник ↗. Вместо схождения к единой последовательности отбор выявил широкий спектр жизнеспособных молекул с высокой мутационной нагрузкой.
Тестирование на терапевтических мишенях
В ходе проверки авторы протестировали малую выборку из 10 вариантов против потенциальной лекарственной мишени, добившись десятикратного роста аффинности с сохранением высокой технологичности молекул. Кроме того, алгоритм LAffAb применили к готовому терапевтическому антителу: инженерам удалось повысить его технологические свойства и стабильность без потери исходной силы связывания с мишенью doi.org
Nature Communicationsdoi.orgОткрыть источник ↗.
