Учёные из Чхуннама связали сезонную микробиоту салата с микробиомом кишечника человека

Исследователи из Национального университета Чхуннам и Национального университета Чеджу изучили состав бактерий и грибов на поверхности листьев салата и оценили их потенциальный перенос в пищеварительную систему человека, сообщает nature.com nature.comnature.comnature.comОткрыть источник ↗. В течение 12 месяцев авторы отобрали 143 образца зелёного и красного салата в торговых точках Тэджона (Южная Корея). Высокопроизводительное ампликонное секвенирование гена 16S рРНК и региона ITS2 выявило 5610 бактериальных и 5016 грибковых вариантов последовательностей (ASV).

Культивирование показало наличие около 5,0 log КОЕ бактерий и 3,4 log КОЕ грибов на грамм растительной ткани. Сообщества микроорганизмов салата отличались от профилей 14 других изученных овощей и фруктов: для латука были характерны грибы родов Cladosporium и Bulleromyces, а также бактерии Massilia и Sphingomonas.

Сезонная динамика и стабильность сетей

Структура эпифитной микробиоты зависела преимущественно от месяца сбора и метеорологических факторов, в то время как сорт растения оказывал наименьшее влияние. Сообщества разделились на два выраженных цикла: ранний сезон (S1, с декабря по июнь) и поздний сезон (S2, с июля по ноябрь) nature.comnature.comnature.comОткрыть источник ↗. Разделение подтвердилось классификацией: к соответствующему периоду отнесли 87,3% образцов зелёного и 75,6% красного салата.

Смена сезона с S1 на S2 сопровождалась ростом видового богатства сезонных таксонов и изменением состава постоянных бактериальных популяций. Эти процессы привели к формированию более сложных и стабильных микробных сетей во второй половине года, при этом частота обогащения потенциально патогенными родами грибов снизилась.

Сопоставление с микробиомом человека

Для оценки переноса микроорганизмов через пищу исследователи сопоставили операционные таксономические единицы салата (порог сходства 97%) с профилями кала 3254 человек по бактериям и 2831 человека по грибам nature.comnature.comnature.comОткрыть источник ↗. Ассоциированные с салатом микроорганизмы регулярно обнаруживались в кишечнике людей, причём бактерии выявлялись чаще грибов.

Сезонные растительные таксоны определялись в кишечных данных чаще, чем постоянные. Бактерии с листьев салата преимущественно встречались совместно с комменсальными кишечными бактериями, утилизирующими гликаны нерастительного происхождения. Обогащение этими совместными группами положительно коррелировало с общим видовым богатством микробиоты кишечника. По данным авторов, формирование этого микробного пула регулируется как нейтральными, так и детерминированными процессами.