Платформа FIND применила ДНК-нанопереключатели для скрининга молекул in vitro

Исследователи разработали платформу Functional Interaction–based Nanoswitch Discovery (FIND) для поиска соединений, модулирующих белок-белковые взаимодействия, сообщает журнал Science doi.orgSciencedoi.orgОткрыть источник ↗. Технология объединяет селекцию библиотек с нуклеотидным кодированием на основе ДНК-нанопереключателей и секвенирование следующего поколения для прямого анализа многочастичных взаимодействий и образования тройных комплексов doi.orgSciencedoi.orgОткрыть источник ↗.

Работу системы авторы проверили в лабораторных тестах doi.orgSciencedoi.orgОткрыть источник ↗. С помощью FIND ученые выявили нанотела, которые стабилизируют связь между ангиотензинпревращающим ферментом 2 (ACE2) и рецептор-связывающим доменом коронавируса SARS-CoV-2 doi.orgSciencedoi.orgОткрыть источник ↗. Кроме того, платформа идентифицировала агонисты гамма-рецептора, активируемого пролифератором пероксисом, из библиотеки малых молекул с ДНК-баркодами doi.orgSciencedoi.orgОткрыть источник ↗.

Стандартные подходы к скринингу часто ограничены по производительности или не позволяют напрямую тестировать многочастичные комплексы doi.orgSciencedoi.orgОткрыть источник ↗. Разработанный метод обеспечивает прямое обнаружение молекул, индуцирующих или усиливающих взаимодействия белков doi.orgSciencedoi.orgОткрыть источник ↗.