Метаанализ 20 РНК-секвенирований на грызунах выявил роль фактора AP-1 в пластичности мозга

Метаанализ, проведенный исследователями из Института нейронаук (совместного центра CSIC и Университета Мигеля Эрнандеса в Эльче) и Варшавского университета, выявил устойчивые закономерности экспрессии генов, связанные со стимуляцией мозга грызунов внешней средой, сообщает EurekAlert eurekalert.orgEurekAlerteurekalert.orgОткрыть источник ↗. Первичный поиск авторов охватил более 300 публикаций, из которых для детального анализа отобрали 20 работ, основанных на РНК-секвенировании eurekalert.orgEurekAlerteurekalert.orgОткрыть источник ↗. Стандартизация данных и их объединение с помощью трех статистических методов позволили выделить повторяющиеся молекулярные сдвиги, не зависящие от специфики отдельных экспериментов eurekalert.orgEurekAlerteurekalert.orgОткрыть источник ↗.

В рассмотренных экспериментах грызуны содержались в обогащенной среде с расширенными возможностями для движения, исследования пространства и социальных контактов eurekalert.orgEurekAlerteurekalert.orgОткрыть источник ↗. Согласно результатам, опубликованным в журнале Molecular Neurobiology, выявленный молекулярный профиль включает гены, отвечающие за функционирование синапсов и синаптическую пластичность eurekalert.orgEurekAlerteurekalert.orgОткрыть источник ↗. Эти механизмы определяют способность нейронных связей перестраиваться в ответ на внешнюю активность и опыт eurekalert.orgEurekAlerteurekalert.orgОткрыть источник ↗.

Роль комплекса AP-1

Анализ показал высокую активность генов быстрого ответа на стимуляцию нейронов, включая семейства Fos и Jun eurekalert.orgEurekAlerteurekalert.orgОткрыть источник ↗. Кодируемые ими белки формируют комплекс транскрипционного фактора AP-1, который регулирует экспрессию множества генов межнейронной коммуникации eurekalert.orgEurekAlerteurekalert.orgОткрыть источник ↗. Эти данные согласуются с более ранними экспериментами авторов на мышах, где было показано участие комплекса AP-1 в формировании долговременных когнитивных изменений под влиянием раннего жизненного опыта eurekalert.orgEurekAlerteurekalert.orgОткрыть источник ↗.

Платформа mEEtaBrain

Для доступа к массиву результатов исследовательская группа запустила открытое веб-приложение mEEtaBrain eurekalert.orgEurekAlerteurekalert.orgОткрыть источник ↗. Платформа дает возможность фильтровать полученные данные по конкретным генам, отделам мозга и параметрам статистического анализа eurekalert.orgEurekAlerteurekalert.orgОткрыть источник ↗. Авторы подчеркивают, что выявленные транскриптомные паттерны получены на грызунах и требуют дальнейших экспериментальных проверок причинно-следственных связей перед экстраполяцией на человека eurekalert.orgEurekAlerteurekalert.orgОткрыть источник ↗.