Крио-ЭМ-структура фага Goslar: 2888 белковых цепей из 28 структурных белков
Исследователи построили составную модель фага Goslar семейства Chimalliviridae, заражающего E. coli, и нашли у базальной пластины нити с углевод-связывающими доменами.
Исследователи определили структуру Goslar, бактериофага семейства Chimalliviridae, заражающего Escherichia coli, методом криоэлектронной микроскопии, сообщается в статье в Science Advances. Фаги этого семейства строят внутри зараженных бактериальных клеток компартменты, которые в целом защищают их геномы от систем защиты хозяина science.org
Science Advancesscience.orgОткрыть источник ↗.
Авторы вручную смоделировали 25 структурных белков и добавили предсказанные структуры ещё трёх. Составная модель содержит 2888 белковых цепей из 28 разных структурных белков, всего более 1,4 млн аминокислотных остатков. Она показывает устройство капсида, портала, хвоста и базальной пластины, а также сходства и отличия от других хвостатых фагов.
Совместив структуру с количественной масс-спектрометрией вирионов, авторы выявили несколько многокопийных белков вириона, которые, вероятно, играют ключевую роль после попадания в клетку хозяина при заражении. Они также нашли специфичное для Chimalliviridae семейство белков, образующих длинные гибкие нити, закреплённые на базальной пластине. В нитях есть углевод-связывающие домены, что, по мнению авторов, указывает на ключевую роль в распознавании хозяина.
