# SNV кишечных бактерий связали с 69 признаками хозяина у 10 781 человека в шести когортах, Nature

- Опубликовано: 2026-11-05 17:49 UTC
- Раздел: Жизнь и здоровье › Биология и биохимия
- Теги: SNV микробиома кишечника, генетические варианты микробов, шотган-метагеномика, Faecalibacterium prausnitzii, линейная смешанная модель, микробиом на уровне штаммов, Dutch Microbiome Project
- Адрес: https://realtech.media/ru/news/rt-c707b8118404a861dd953e8e_snv_kishechnykh_bakteriy/

**Общегеномный по фенотипам анализ 12,8 млн SNV кишечных бактерий выявил 940 независимых ассоциаций с возрастом, полом и метаболическими параметрами; результаты открыты в каталоге.**

![Gut microbial SNVs linked to 69 host traits in 10,781 people across six cohorts, Nature reports](https://sgzwpqqelzmajkcubgkl.supabase.co/storage/v1/object/public/rt-media/2026/11/11681ab8057e82b5.png)
*Nature*

Группа исследователей, создавшая онлайн-каталог SNV-MWAS, опубликовала в Nature фенотип-широкое ассоциативное исследование (PheWAS) однонуклеотидных вариантов (SNV) кишечных микробов. Анализ охватил 12,8 млн SNV и 244 фенотипа и средовых воздействия у 10 781 человека из шести независимых когорт [1].

Авторы объединили данные шотган-метагеномного секвенирования 11 831 образца кала. Пять когорт из Нидерландов: Dutch Microbiome Project (n = 7955), Lifelines-DEEP (n = 1135), 500-Functional Genomics Project (n = 529), 1000 IBD Project (n = 544) и 300-Obesity (n = 298). Шестая — танзанийская когорта 300TZFG (n = 320) [1].

## Дизайн анализа

Генотипы микробов определяли с помощью GT-Pro в кодирующих («коровых») областях геномов. 244 фактора включали 92 бинарных и 152 непрерывных или порядковых признака; объём выборки на фенотип составлял от 593 до 11 706 [1].

Авторы разработали подход на основе линейной смешанной модели, который учитывает внутривидовую популяционную структуру, так что ассоциации не зависят от совокупного эффекта линии штамма. Каждую когорту анализировали отдельно, затем проводили метаанализ. Независимые сигналы выделяли группировкой по неравновесию по сцеплению, а устойчивые отбирали пермутационным тестом [1].

Дополнительные наборы данных Lifelines-DEEP (повторный визит) и 500FG, обработанные двумя наборами для выделения ДНК, использовали только для технической оценки влияния протокола экстракции на профилирование SNV [1].

## Ассоциации и структура белков

Исследование выявило 940 независимых сигналов ассоциации, подтверждённых несколькими когортами. Они связывают 39 663 SNV из 101 вида с 69 фенотипами или воздействиями хозяина, включая возраст, пол, сердечно-сосудистые и метаболические параметры [1].

Структурный анализ белков показал, что SNV, связанные с фенотипами хозяина, расположены в функционально важных участках белков. По мнению авторов, это позволяет формулировать механистические гипотезы о связи генетических изменений микробов с физиологией хозяина и средой. Пример — связанный с возрастом SNV у Faecalibacterium prausnitzii, затрагивающий аминокислоту в кармане белка, связывающем глутатион [1].

Результаты являются ассоциациями и не доказывают причинность. Вся сводная статистика доступна в онлайн-каталоге fulab.web.rug.nl/SNV-MWAS, который авторы называют ресурсом для генерации гипотез о функциях кишечной микробиоты на уровне штаммов [1].

## Источники

1. [Nature](https://doi.org/10.1038/s41586-026-11220-0)

---

Источник: RealTech, realtech.media — https://realtech.media/ru/news/rt-c707b8118404a861dd953e8e_snv_kishechnykh_bakteriy/