# RETrace2 от Altos Labs прослеживает линии клеток по гомополимерам у мышей с дефектом Msh2

- Опубликовано: 2026-11-08 17:59 UTC
- Раздел: Жизнь и здоровье › Биология и биохимия
- Теги: изменчивые гомополимеры, одноклеточный двухомиксный метод, микросателлитные повторы, мыши с дефектом Msh2, определение типа клеток, соматические мутации, профили метилирования ДНК
- Адрес: https://realtech.media/ru/news/rt-8d3dc927a57fd175d3184bb9_retrace2_ot_altos/

**Авторы описали одноклеточный метод: в одних клетках считываются гомополимеры и метилирование, разрешение — менее пяти делений у организмов с микросателлитной нестабильностью.**

![Altos Labs' RETrace2 traces cell lineages with homopolymers in Msh2-deficient mice](https://realtech.media/media/2026/11/4d0e5b5c1151fcb3.jpg)
*Air Force Staff Sgt. Nicole Leidholm, photographer, Wikimedia Commons, Public domain*

Группа из Altos Labs, Калифорнийского университета в Сан-Диего, Венского медицинского университета и других институтов описала RETrace2 — одноклеточный двухомиксный метод для одновременного прослеживания клеточных линий и определения типа клеток. Статья опубликована 7 ноября 2026 года в Nature Communications; корреспондирующий автор — Кун Чжан. [1] Авторы проверили метод in vitro и на мышах с дефектом гена Msh2. [1]

## Гомополимеры как маркеры линий

Ретроспективная реконструкция клеточных линий по соматическим мутациям нужна для изучения развития, поддержания тканей и болезней. По словам авторов, существующие подходы ограничены низкой плотностью маркеров, техническим шумом и неполным молекулярным считыванием, что снижает разрешение и точность восстановленных линий. [1]

RETrace2 нацелен на сильно изменчивые гомополимеры. Авторы показали, что они примерно вдвое информативнее обычных микросателлитных повторов. [1] В метод также вошли технические улучшения, которые увеличивают покрытие маркеров и уменьшают экспериментальные ошибки при считывании и амплификации гомополимеров. [1]

С этими изменениями, по оценке авторов, RETrace2 способен непрерывно прослеживать линию с разрешением менее пяти клеточных делений у организмов с микросателлитной нестабильностью. [1]

## Проверка и считывание метилирования

Из тех же клеток метод получает разреженные профили метилирования, по которым определяют тип клеток. [1] Таким образом, линия и тип клетки считываются в каждой отдельной клетке.

Авторы проверили RETrace2 на моделях in vitro с известной истинной структурой линий. [1] In vivo они восстановили многоорганные деревья линий по мозгу, почке и печени мышей с дефектом Msh2. [1]

Указанное разрешение — оценка для организмов с микросателлитной нестабильностью, а демонстрация in vivo выполнена на мышиной модели с дефектом гена Msh2. [1]

## Источники

1. [Nature Communications](https://doi.org/10.1038/s41467-026-79104-5)

---

Источник: RealTech, realtech.media — https://realtech.media/ru/news/rt-8d3dc927a57fd175d3184bb9_retrace2_ot_altos/