# Weill Cornell и Нью-Йоркский геномный центр создали D&D-seq для картирования белок-ДНК в клетках

- Опубликовано: 2026-11-10 14:25 UTC
- Раздел: Наука › Приборы и эксперименты
- Теги: D&D-seq, белок-ДНК взаимодействия, места связывания факторов транскрипции, одноклеточная мультиомика, деаминаза, ремоделирование хроматина, регуляция генов, Нью-Йоркский геномный центр, Медицинский колледж Вейлл Корнелл, журнал Cell
- Адрес: https://realtech.media/ru/news/rt-7e6e26742beb0d4705b81796_weill_cornell_i/

**Метод подводит антителами деаминазу к целевому белку и читает места связывания секвенированием. По данным авторов, он совместим со стандартными одноклеточными мультиомными платформами.**

![Weill Cornell and NYGC researchers build D&D-seq to map protein–DNA binding in single cells](https://realtech.media/media/2026/11/f2283c58ea346b71.jpg)
*innovanews.ru*

Исследователи из Медицинского колледжа Вейлл Корнелл и Нью-Йоркского геномного центра под руководством доктора Дэна Ландау разработали D&D-seq — метод, который картирует в отдельных клетках места связывания ДНК с факторами транскрипции и другими регуляторными белками. Статья с описанием опубликована в журнале Cell, сообщает innovanews.ru [1]. Антитела подводят фермент, редактирующий ДНК, к целевому белку, что позволяет зафиксировать, где именно этот белок контактирует с ДНК [1].

## Как работает D&D-seq

Название происходит от стыковки (docking) целевого белка с ферментом деаминазой и последующего обычного секвенирования. Даже кратковременное связывание белка, соединённого с деаминазой, с ДНК оставляет след, который можно обнаружить в данных секвенирования [1]. Авторы сообщают, что метод преодолевает ключевые технические недостатки существующих способов картирования белок-ДНК взаимодействий [1].

У этих способов, как следует из материала, относительно низкая чувствительность к слабым или кратковременным событиям связывания, и они несовместимы с другими стандартными мультиомными инструментами. Из-за этого сложнее получить общую картину регуляции гена или сети генов. Большая доля горячих точек риска заболеваний, выявленных в генетических исследованиях, находится именно в местах связывания факторов транскрипции [1].

## Демонстрация и совместимость

Чтобы показать потенциал D&D-seq, команда картировала места связывания нескольких факторов транскрипции и белков ремоделирования хроматина, которые локально открывают или закрывают скрученную структуру ДНК. В клетках крови они картировали связывание ключевого фактора транскрипции и сравнили клетки с распространённой мутацией лейкемии и без неё. Это позволило детально увидеть, как мутация меняет связывание фактора [1].

Авторы указывают, что метод ещё дорабатывается и планируется множество улучшений, но его уже можно использовать со стандартными одноклеточными мультиомными платформами. Это позволяет картировать белок-ДНК взаимодействия вместе с показателями активности генов, последовательностями генома и другими омиксными слоями в тех же клетках [1]. По словам доктора Ивана Раймонди, второго соавтора-руководителя, D&D-seq не привязан к конкретной платформе и по сути является подключаемой функцией, которую можно добавить к существующим платформам [1].

Доктор Ландау заявил, что факторы транскрипции и другие регуляторы активности генов всё чаще становятся терапевтическими мишенями, а подобные технологии должны помочь в разработке и оценке таких методов лечения [1]. Первые соавторы статьи — Вэй-Ю Чи и доктор Сан-Хо Юн [1].

## Источники

1. [innovanews.ru](https://innovanews.ru/info/news/health/uchenye-predlozhili-podklyuchaemyy-instrument-dlya-izucheniya-regulyaczii-genov-v-otdelnyx-kletkax)

---

Источник: RealTech, realtech.media — https://realtech.media/ru/news/rt-7e6e26742beb0d4705b81796_weill_cornell_i/
