# Пан-геномный анализ подсолнечника: 1433 гена-кандидата устойчивости к болезням, 198 нет в референсе

- Опубликовано: 2026-11-14 06:03 UTC
- Раздел: Жизнь и здоровье › Агротех и еда
- Теги: селекция подсолнечника, пан-геномный анализ, гены-кандидаты устойчивости, NBS-содержащие гены, Sclerotinia sclerotiorum, дикие родственники подсолнечника, LTR-ретротранспозоны, неравновесное сцепление, дифференциальная экспрессия генов
- Адрес: https://realtech.media/ru/news/rt-5cbd737f4790a5e3dc7557d3_pan_genomnyy_analiz/

**Авторы объединили аннотацию референса с секвенированием 100 культурных и 49 диких образцов подсолнечника и получили приоритизированный список генов для функциональной проверки.**

![Pan-genomic analysis of sunflower finds 1,433 candidate disease-resistance genes, 198 absent from reference](https://realtech.media/media/2026/11/c8f417da787cca10.jpg)
*Björn S., Wikimedia Commons, CC BY-SA 3.0*

Исследователи расширили каталог генов-кандидатов устойчивости к болезням у подсолнечника: они объединили аннотацию референсного генома с геномным и транскриптомным анализом многих образцов, сообщается в статье в Plant Molecular Biology (doi.org). Проанализированы данные полногеномного секвенирования 100 культурных образцов подсолнечника и 49 диких родственников. Всего выявлено 1433 гена-кандидата устойчивости к болезням [1].

Генотипы подсолнечника заметно различаются по устойчивости к патогенам, а значительная часть устойчивости, используемой в селекции, происходит от диких родственников. Однако многие гены, лежащие в основе этой устойчивости, остаются неизвестными, что ограничивает целевую селекцию [1].

## Как найдены кандидаты

Сначала авторы дополнили существующую аннотацию референса предсказанием de novo дополнительных генов, содержащих NBS-домен. Затем они собрали прочтения, не картировавшиеся на референсный геном, и так нашли нереференсные гены-кандидаты (пан-гены) [1]. Итоговый набор включает 1235 генов, основанных на референсе, и 198 нереференсных пан-генов [1].

Референсные гены распределены по геному неравномерно. Значительная их часть собрана в кластеры, и эти кластеры расположены заметно ближе к LTR-ретротранспозонам, чем одиночные гены [1]. Команда также охарактеризовала вариации последовательностей и структуры в панели образцов: SNP, инделы и крупные делеции [1].

## Экспрессия и приоритизация

Геномные данные сопоставили с транскриптомным ответом на заражение Sclerotinia sclerotiorum. Хотя бы в одном из двух контрастных генотипов дифференциально экспрессировались 548 генов-кандидатов [1].

Тридцать три гена-кандидата находились в неравновесном сцеплении с ранее описанными локусами, связанными с устойчивостью к болезням. Десять из них также дифференциально экспрессировались после заражения, восемь были полиморфными [1].

По словам авторов, анализ расширяет каталог генов-кандидатов и геномной изменчивости подсолнечника. Они называют результат приоритизированным набором кандидатов и генетических ресурсов для последующей функциональной проверки и использования в селекции [1]. Работа выявляет кандидатов; роль этих генов в устойчивости пока не подтверждена.

## Источники

1. [doi.org](https://doi.org/10.1007/s11103-026-01768-w)
2. [bioengineer.org](https://bioengineer.org/pan-genomic-analysis-identifies-candidate-disease-resistance-genes-for-sunflower-breeding)

---

Источник: RealTech, realtech.media — https://realtech.media/ru/news/rt-5cbd737f4790a5e3dc7557d3_pan_genomnyy_analiz/