# Платформа dual-sgRNA CRISPRi построила карты взаимодействий жизненно важных генов M. tuberculosis

- Опубликовано: 2026-11-05 22:36 UTC
- Раздел: Жизнь и здоровье › Биология и биохимия
- Теги: картирование генетических взаимодействий, dual-sgRNA CRISPRi, Mycobacterium tuberculosis, жизненно важные гены, CombiGEM, синтетическая летальность, комбинированная терапия, Mycobacterium smegmatis, электрон-транспортная цепь, секвенирование баркодов
- Адрес: https://realtech.media/ru/news/rt-5c73bbed5d18b1b9836f2c93_platforma_dual_sgrna/

**Авторы создали платформу dual-sgRNA CRISPRi и построили карты взаимодействий жизненно важных генов в культурах M. smegmatis и M. tuberculosis, включая связи с мишенями лекарств.**

![Dual-sgRNA CRISPRi maps essential-gene interactions in M. tuberculosis, revealing thousands of new pairs](https://sgzwpqqelzmajkcubgkl.supabase.co/storage/v1/object/public/rt-media/2026/11/64fbe48e3deeac2c.jpg)
*Syed Sajidul Islam, Wikimedia Commons, CC BY-SA 4.0*

Исследователи разработали платформу dual-sgRNA CRISPR-интерференции (CRISPRi) для высокопроизводительного картирования генетических взаимодействий (GI) у микобактерий. С её помощью они построили карты взаимодействий жизненно важных генов Mycobacterium smegmatis и Mycobacterium tuberculosis, сообщается в статье в Nature [1]. Туберкулёз остаётся ведущей инфекционной причиной смерти в мире, а многие гены M. tuberculosis до сих пор плохо охарактеризованы [1].

## Платформа и дизайн библиотеки

GI — это комбинированный фенотип, отклоняющийся от ожидаемого по эффектам отдельных генов. Отрицательные взаимодействия, включая синтетическую летальность, дают более тяжёлый фенотип, положительные — более мягкий [1]. Авторы адаптировали подход CombiGEM к платформе CRISPRi для M. tuberculosis и присвоили каждой sgRNA баркод, так что численность штаммов с двумя sgRNA определяется секвенированием баркодов [1].

Пилотный скрининг на M. smegmatis включал 16 генов, для которых предсказано взаимодействие, и до 24 sgRNA на ген. Он определил силу sgRNA, оптимальную для выявления GI: снижение приспособленности примерно на 8% за поколение [1]. Исходя из этого, команда собрала библиотеку из 1524 sgRNA, нацеленных на 787 генов, плюс 10 контролей без мишени, что даёт около 2,3 млн комбинаций sgRNA. Мишени включали гены, жизненно важные для M. smegmatis, и гены, которые у неё не являются жизненно важными, но важны для M. tuberculosis [1].

## Карты взаимодействий и проверка

Карты охватывают почти все жизненно важные гены обоих видов. Они воспроизводят известные биологические связи и, по данным авторов, выявляют тысячи ранее не описанных взаимодействий и функциональные связи между жизненно важными генами и мишенями лекарств [1].

Для примерно 600 000 пар генов из карт авторы получили предсказания белок-белковых взаимодействий методом компьютерного ко-фолдинга. По их данным, часть GI, вероятно, отражает физические ассоциации белков [1].

Отдельные результаты проверили экспериментально. Проверка касалась взаимодействий между препаратами и роли в электрон-транспортной цепи нескольких генов с неизвестной функцией. Авторы сообщают, что она подтвердила новые биологические связи и возможности синергичного воздействия [1]. Работа выполнена на бактериальных культурах. Авторы описывают её как универсальный подход к двойному возмущению генов и ресурс для рационального проектирования комбинированной терапии [1].

## Источники

1. [Nature](https://doi.org/10.1038/s41586-026-11212-0)

---

Источник: RealTech, realtech.media — https://realtech.media/ru/news/rt-5c73bbed5d18b1b9836f2c93_platforma_dual_sgrna/