# Rockefeller University картировал взаимодействия жизненно важных генов M. tuberculosis

- Опубликовано: 2026-11-05 12:11 UTC
- Раздел: Жизнь и здоровье › Биотехнологии
- Теги: Mycobacterium tuberculosis, карта генетических взаимодействий, двойной CRISPRi, жизненно важные гены, Mycobacterium smegmatis, мишени против туберкулёза, комбинированная терапия, цепь переноса электронов, CombiGEM, Джереми Рок
- Адрес: https://realtech.media/ru/news/rt-35babc5f012deea2f6e3f612_rockefeller_university_kartiroval/

**Исследователи создали платформу на основе двойного CRISPRi и описали взаимодействия почти всех жизненно важных генов M. tuberculosis и M. smegmatis, найдя тысячи новых.**

![Rockefeller University maps genetic interactions of essential genes in M. tuberculosis](https://sgzwpqqelzmajkcubgkl.supabase.co/storage/v1/object/public/rt-media/2026/11/b0610893b66403d5.jpg)
*Syed Sajidul Islam, Wikimedia Commons, CC BY-SA 4.0*

Исследователи Rockefeller University из лаборатории биологии взаимодействия хозяина и патогена Джереми Рока опубликовали в Nature карту генетических взаимодействий между жизненно важными генами Mycobacterium tuberculosis (Mtb) и модельного вида Mycobacterium smegmatis (Msm). Статья доступна через dx.doi.org, университет сообщил о ней 4 ноября 2026 года [1]. Карты охватывают почти все жизненно важные гены обоих видов и, по данным авторов, выявляют тысячи ранее не описанных взаимодействий [1].

Mtb вызывает туберкулёз, который авторы называют ведущей в мире инфекционной причиной смерти. Функции многих его генов не изучены, что ограничивает понимание болезни и сдерживает разработку лекарств [1]. Лечение обычно требует нескольких антибиотиков в течение месяцев, а лекарственно-устойчивые формы инфекции поддаются дольше.

## Платформа двойного CRISPRi с sgRNA

Генетическое взаимодействие — это совместный фенотип, отклоняющийся от ожидаемого по эффектам отдельных генов. Отрицательные взаимодействия, включая синтетическую летальность, дают более тяжёлый фенотип, чем ожидалось, положительные — более мягкий [1]. Прежние подходы на основе транспозонов в Mtb обычно ограничивались нежизненно важными генами, что исключает большинство мишеней антибиотиков [1].

Команда адаптировала подход CombiGEM к платформе CRISPR-интерференции для Mtb. Каждой sgRNA присвоили уникальный штрихкод, а схема клонирования сохраняет связь sgRNA со штрихкодом и располагает парные штрихкоды рядом. Это позволяет оценивать численность каждого штамма с двумя sgRNA секвенированием штрихкодов [1]. Авторы также внедрили статистический конвейер для надёжного выявления взаимодействий [1].

## Результаты и проверка

Карты воспроизводят известные биологические связи и выявляют функциональные связи между жизненно важными генами и мишенями лекарств [1]. Кроме того, авторы выполнили структурные предсказания белок-белковых взаимодействий примерно для 600 000 пар генов, вошедших в карты. По их сообщению, часть взаимодействий, вероятно, отражает физические контакты белков [1].

Отдельные взаимодействия проверили экспериментально. Проверка охватила лекарственные взаимодействия и роль в дыхательной цепи переноса электронов для нескольких генов с неизвестной функцией [1]. Авторы заявляют, что работа даёт обобщаемую схему для двойного возмущения генов и описывает архитектуру сетей жизненно важных генов у микобактерий [1].

Все эксперименты выполнены на бактериальных культурах. Проверка новых препаратов или схем лечения в статье не описана. Рок сказал, что это первая полная карта взаимодействий жизненно важных генов у патогена.

## Источники

1. [dx.doi.org](http://dx.doi.org/10.1038/s41586-026-11212-0)
2. [EurekAlert](https://www.eurekalert.org/news-releases/1150421)

---

Источник: RealTech, realtech.media — https://realtech.media/ru/news/rt-35babc5f012deea2f6e3f612_rockefeller_university_kartiroval/