# Факторы транскрипции GATA координируют переход от деления к дифференцировке в корне арабидопсиса

- Опубликовано: 2026-11-05 02:27 UTC
- Раздел: Жизнь и здоровье › Биология и биохимия
- Теги: корень арабидопсиса, факторы транскрипции GATA, одноклеточное секвенирование РНК, доступность хроматина, основная ткань, эндодерма и кора, пролиферация и дифференцировка, бистабильная регуляторная сеть, сигналы ауксина и цитокинина
- Адрес: https://realtech.media/ru/news/rt-2b2ddbe7438e2b32dcb1f444_faktory_transkriptsii_gata/

**Данные одноклеточной транскриптомики и доступности хроматина для основной ткани корня арабидопсиса указывают на факторы GATA как регуляторы перехода от деления клеток к дифференцировке.**

![GATA transcription factors coordinate the switch from division to differentiation in Arabidopsis root](https://sgzwpqqelzmajkcubgkl.supabase.co/storage/v1/object/public/rt-media/2026/11/c9851b271b240ff3.png)
*Nature Communications*

Авторы работы в Nature Communications реконструировали траектории развития основной ткани корня Arabidopsis thaliana, в которую входят эндодерма и кора. Они работали с разрешением до отдельных клеток и использовали данные по транскриптому и доступности хроматина [1]. Анализ выявил факторы транскрипции GATA как центральных координаторов перехода от деления клеток к дифференцировке; эту роль авторы подтвердили экспериментально [1].

## Одноклеточная траектория основной ткани

В работе использованы ранее опубликованные данные scRNA-seq Arabidopsis thaliana. В атласе примерно из 11 000 клеток клетки стволовой ниши, эндодермы и коры определили по маркерным генам [1]. Кластер стволовой ниши проверили вручную, чтобы исключить клетки эпидермальной и сосудистой линий. По словам авторов, это заметно повысило разрешение итоговой траектории. Клетки колумеллы оставили, поскольку они фиксируют базальный конец траектории [1].

Итоговая выборка из 1095 клеток образует траекторию, раздваивающуюся на одном конце; это отражает анатомическое разделение основной ткани на эндодерму и кору [1]. Экспрессия меняется постепенно от конца колумеллы и покоящегося центра до области перед точкой ветвления, где профиль экспрессии резко меняется. В траектории, ведущей к коре, авторы описывают пять чётких фаз экспрессии, соответствующих расположению клеточных кластеров [1].

## Факторы GATA и бистабильная сеть

Авторы сообщают, что доступность хроматина — надёжный предиктор активации генов развития. Крупный транскрипционный переключатель в поздней меристематической зоне, сопровождаемый обширной перестройкой хроматина, запускает переход от деления клеток к дифференцировке [1].

Чтобы найти регуляторы этого переключателя, авторы применили сетевой вывод на объединённых траекториях транскриптома и доступности хроматина. Он указал на факторы транскрипции GATA [1]. По данным авторов, эти факторы находятся в точке перегиба бистабильной генной регуляторной сети с обратными связями. Сеть объединяет сигналы ауксина и цитокинина и уравновешивает пролиферацию и дифференцировку [1]. Как сообщают авторы, это обеспечивает временную точность переключения на уровне клетки, ткани и органа [1].

Корень удобен как модель для такого вопроса. Его типы клеток расположены концентрическими кольцами, которые берут начало от стволовой ниши у кончика. Дочерние клетки проходят несколько циклов деления, прежде чем начать удлиняться и дифференцироваться в чётко очерченных продольных зонах [1].

## Источники

1. [Nature Communications](https://doi.org/10.1038/s41467-026-78787-0)

---

Источник: RealTech, realtech.media — https://realtech.media/ru/news/rt-2b2ddbe7438e2b32dcb1f444_faktory_transkriptsii_gata/